More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2447 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  86.96 
 
 		 213 aa  341  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  78.39 
 
 		 210 aa  308  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  77.89 
 
 		 210 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  77.89 
 
 		 210 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  41.75 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 222 aa  97.8  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 208 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 224 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 215 aa  88.2  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  32.98 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  30.98 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  31.16 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  30.2 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  32.79 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 261 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  30 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  40.96 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2413  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  48.08 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  49.12 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  29.46 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>