More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1756 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 205 aa  147  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 195 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  37.5 
 
 		 211 aa  107  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 221 aa  104  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  32.83 
 
 		 214 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  31.4 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  29.86 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  28 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  32.98 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  35.17 
 
 		 280 aa  71.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24750  hypothetical protein  52.73 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.145821  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  33.68 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 244 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  46.15 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  38.93 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.65 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.65 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 403 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>