More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1023 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 269 aa  528  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  55.5 
 
 		 193 aa  224  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  41.78 
 
 		 207 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 205 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  39.07 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  36.1 
 
 		 207 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 196 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  36.4 
 
 		 211 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 195 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 196 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  34.96 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 199 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 221 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 203 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  32.27 
 
 		 214 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 214 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 222 aa  95.9  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 207 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 205 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  31.41 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 195 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 216 aa  92.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 200 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  30.94 
 
 		 219 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 218 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 208 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 195 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 213 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  27.32 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  43.59 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  28.66 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 445 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 187 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 482 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 482 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 434 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  38.89 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 186 aa  50.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 204 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 202 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 186 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 204 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 226 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 199 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>