More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1508 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  45.81 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 205 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  39.52 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  33.7 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  36.99 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  35.12 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 195 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 195 aa  99  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  36.78 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  92.4  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  33.53 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 193 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 216 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 269 aa  84.7  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 346 aa  72.4  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  34.74 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.9 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  45.9 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  48.44 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.08 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.18 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  60 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  29.5 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  26.15 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  26.15 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.15 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>