More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  65.31 
 
 		 214 aa  256  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  47.4 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 202 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  39.88 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 193 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 269 aa  104  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  34.95 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  31.69 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  28.71 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  31.79 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  27.27 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 275 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 277 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  51.92 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  24.31 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 283 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>