More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3149 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  62.19 
 
 		 202 aa  241  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  43.17 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  43.94 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 205 aa  147  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 196 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  38.31 
 
 		 203 aa  137  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 269 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  36.81 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  55.45 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  33.66 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 226 aa  111  7.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 221 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 218 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 195 aa  88.6  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  29.9 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 243 aa  85.1  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  36.73 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>