More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0744 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  74.64 
 
 		 211 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  74.64 
 
 		 211 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  74.64 
 
 		 211 aa  318  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0103  TetR family transcriptional regulator  80.75 
 
 		 187 aa  309  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 280 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  26.67 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  26.67 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  26.67 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.67 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  26.51 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  26.51 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.67 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 461 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  25.93 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.69 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  26.4 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>