More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6828 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  46.74 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 182 aa  92  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  29.83 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  30.77 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  49.06 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  39.73 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  53.06 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 332 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 280 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 291 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 357 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  41.27 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>