More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30610 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 238 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 374 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22310  transcriptional regulator, tetR family  37.4 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  39.73 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  58.54 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  34.85 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2117  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 362 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583843  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 335 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  37.65 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  37.14 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>