More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2349 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 357 aa  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  44.65 
 
 		 187 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 192 aa  155  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 186 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 188 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 190 aa  152  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 187 aa  143  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 186 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 187 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 187 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  46.91 
 
 		 187 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 190 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  55.95 
 
 		 141 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 244 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 227 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 199 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 191 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 227 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 236 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 175 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 196 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 179 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 178 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 179 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 203 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  37.18 
 
 		 197 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 197 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 178 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 186 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 187 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  31.87 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 184 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 183 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 196 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 175 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.98 
 
 		 210 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 196 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  34.72 
 
 		 224 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 196 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 196 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 183 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 192 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 187 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 187 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 186 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 214 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 202 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 229 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 195 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 186 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.09 
 
 		 197 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 248 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 178 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 172 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 200 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 193 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 196 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 208 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 212 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 196 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 191 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 203 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 224 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  33.71 
 
 		 215 aa  53.1  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 227 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>