More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9154 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 204 aa  84.7  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  28.17 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  50.79 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2939  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0355871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5275  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.398681  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>