More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0882 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.09 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  28.84 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  27.09 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  27.64 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  34.81 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
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NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
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NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
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NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
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NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
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