More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0907 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 239 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  27.83 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  25.5 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  24.34 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1539  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  34.57 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>