More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0081 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 190 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 227 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  56.86 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  45.71 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  35.21 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46.03 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  46.03 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  49.09 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  49.09 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  49.09 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  49.09 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.41 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  29.68 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  33.58 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  47.06 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  39.62 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  41.25 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>