More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2788 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  93.88 
 
 		 196 aa  347  8e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  84.82 
 
 		 195 aa  322  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  80.93 
 
 		 195 aa  314  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  81.15 
 
 		 195 aa  311  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  72.14 
 
 		 201 aa  294  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  72.14 
 
 		 201 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  55.8 
 
 		 199 aa  201  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  57.65 
 
 		 196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 196 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 198 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 197 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 197 aa  177  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  48.22 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 197 aa  171  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  46.35 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 192 aa  95.5  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 209 aa  94.7  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  27.72 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  31.07 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  32.03 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  29.88 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  35.63 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 261 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 249 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  43.66 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 87 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>