More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2845 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  70.41 
 
 		 197 aa  290  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  70.31 
 
 		 199 aa  277  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  55.44 
 
 		 197 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  54.82 
 
 		 197 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  55.96 
 
 		 196 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  55.44 
 
 		 196 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  52.72 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 195 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  47.4 
 
 		 195 aa  171  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  50.87 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  50.29 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 198 aa  91.7  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  39.5 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  25.99 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  26.67 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2653  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0164897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.38 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 376 aa  52.4  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  42.31 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1245  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  42.31 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  42.31 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  42.31 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>