More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3522 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  434  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  34.81 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  30.05 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  41.05 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  43.66 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  31.93 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  31.93 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.07 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.07 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  47.19 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  30.97 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  48.21 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  31.93 
 
 		 340 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  30.97 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 291 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  31.53 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  42.65 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.97 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2619  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  45.83 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  45.83 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 372 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>