More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2209 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  37.69 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 197 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 192 aa  91.3  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  34.52 
 
 		 196 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  30.89 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  34.13 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  28.06 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
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NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
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NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  45.45 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  36.73 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 326 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
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NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 261 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
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NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
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NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
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NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 266 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
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