More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3867 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  76.42 
 
 		 236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  39.13 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  27.43 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  29.34 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  29.85 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  37.88 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 192 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  29.9 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  35.29 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  34.25 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>