More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1604 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  35.92 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 332 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  29.65 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.01 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  54.35 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3898  regulatory protein TetR  35.45 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 186 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.42 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  42.42 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.42 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.42 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.42 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.42 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 437 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>