More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1903 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 198 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 192 aa  98.2  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  31.87 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
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NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 165 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 211 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 189 aa  90.9  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  31.84 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  31.07 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 179 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 187 aa  84.3  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
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NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  28.89 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  29.07 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  29.1 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 600 aa  68.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  22.99 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
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NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
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