More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2163 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 198 aa  299  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  47.57 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  46.24 
 
 		 195 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 193 aa  111  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 192 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 205 aa  98.2  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  34.91 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  28.65 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 179 aa  88.6  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  28.09 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 189 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 196 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 600 aa  79  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  29.38 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  29.55 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  36 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
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NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
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NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
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