More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3422 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  98.4 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  95.72 
 
 		 187 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  95.19 
 
 		 187 aa  362  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  95.19 
 
 		 187 aa  362  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 187 aa  264  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  59.36 
 
 		 187 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  46.59 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  49.7 
 
 		 189 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  43.83 
 
 		 193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  39.89 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 205 aa  121  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 198 aa  97.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  31.06 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  29.51 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 201 aa  94.4  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 196 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 195 aa  91.3  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 187 aa  90.9  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  33.13 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 165 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 600 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  27.84 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  24.43 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
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NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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