239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1743 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  53.16 
 
 		 194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  31.5 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 209 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1789  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00598195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  28.43 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  20.49 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  31.58 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  20.49 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 		 258 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  25.2 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  35.94 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 239 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  20.69 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  19.67 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  19.67 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 251 aa  44.7  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 173 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  37.68 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>