More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4676 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 179 aa  207  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  45.45 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  50.27 
 
 		 191 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  50.27 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 197 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  38.24 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  44.25 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  32.74 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 193 aa  101  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  32.14 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 192 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 187 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 187 aa  91.3  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 600 aa  88.6  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 196 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 201 aa  84.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  31.75 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  21.21 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.21 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 183 aa  51.2  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  45.1 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  28.18 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  20 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>