285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1806 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  66.15 
 
 		 200 aa  272  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 194 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  39.27 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 298 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 225 aa  124  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  23 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.43 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  25.33 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  38.27 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 165 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  27.66 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6134  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0948812  normal  0.0489287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  29.79 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  27.01 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  25.14 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  23.68 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>