More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6827 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  56.7 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 200 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2789  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.08 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  21.29 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1851  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 162 aa  51.6  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 256 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  28.11 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  31.17 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  27.52 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>