More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4925 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  55.88 
 
 		 207 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  54.63 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  40.89 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  44.5 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  44.95 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  42.38 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  39.89 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 266 aa  121  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  33.17 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 206 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 235 aa  95.1  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  29.79 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.74 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 199 aa  62  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40380  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  37.04 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  33.75 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>