More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0318 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  96.97 
 
 		 198 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4584  TetR family transcriptional regulator  93.43 
 
 		 198 aa  370  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  42.44 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  35.64 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.51 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  25.93 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 770 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3426  putative transcriptional regulator  33.05 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4473  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
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NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  23 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  31.37 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  45 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  21.16 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
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