More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4604 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4584  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 376 aa  52  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 302 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  25 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 307 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>