More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1012 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  73.81 
 
 		 216 aa  332  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  67.77 
 
 		 213 aa  297  7e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  66.35 
 
 		 213 aa  292  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  60.48 
 
 		 227 aa  272  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  58.85 
 
 		 217 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  58.85 
 
 		 217 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  58.85 
 
 		 217 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  58.85 
 
 		 217 aa  263  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  58.85 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  58.37 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  58.85 
 
 		 218 aa  261  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  58.85 
 
 		 218 aa  261  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  58.85 
 
 		 218 aa  261  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  57.35 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  57.35 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  57.35 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  57.35 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  57.35 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  57.35 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  57.35 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  57.35 
 
 		 215 aa  252  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  57.35 
 
 		 215 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  42.45 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  43.27 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  44.34 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  44.34 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  44.34 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  44.34 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  44.34 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  44.34 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  41.15 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 219 aa  158  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 213 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  37.44 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  40.48 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3750  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  37.8 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.833551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  37.8 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3580  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  37.8 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3653  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  37.8 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.451581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  37.38 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  36.89 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3687  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  37.32 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0386851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  36.89 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  36.89 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  36.89 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  36.89 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  36.89 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  36.89 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 206 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  34 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 238 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1410  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.398203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38380  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0126427 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  30.81 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  31.31 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  31.31 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  31.31 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  31.31 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  31.31 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>