More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5804 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  500  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  84.82 
 
 		 257 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  83.63 
 
 		 237 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  61.63 
 
 		 259 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  61.63 
 
 		 259 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  61.63 
 
 		 259 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  59.24 
 
 		 250 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  35.89 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 223 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 217 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 210 aa  95.5  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 197 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  41.33 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  30.13 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  35.51 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 497 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1650  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  32.81 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 324 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>