More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1323 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.46 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.46 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.46 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.46 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.46 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.46 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 497 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  27.62 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  32.47 
 
 		 258 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  26.94 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  44.07 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 229 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.07 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.07 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  44.07 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.61 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.07 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.07 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 324 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.07 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.07 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 235 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>