More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4589 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  96.97 
 
 		 198 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4584  TetR family transcriptional regulator  92.42 
 
 		 198 aa  364  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  42.44 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.1 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  35.64 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 254 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 770 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  21.16 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 248 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  20.31 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 244 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  32.22 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
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NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  20.88 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  29.37 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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