More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4691 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  99.51 
 
 		 215 aa  417  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  87.88 
 
 		 208 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  82.29 
 
 		 200 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  79.17 
 
 		 197 aa  326  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  60.43 
 
 		 197 aa  238  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  53.93 
 
 		 204 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  52.13 
 
 		 210 aa  208  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  56.41 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  46.24 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  43.65 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  39.8 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 208 aa  96.3  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 202 aa  92  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 228 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  28.87 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 234 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 434 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  29.56 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.23 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  29.89 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 445 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
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NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
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NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
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