More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1515 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  51.81 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  41.08 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 189 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 189 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  33.52 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  30.87 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  43.88 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 286 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  29.51 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5139  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  31.17 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  31.79 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>