More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2846 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 227 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  39.6 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  40.96 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  39.53 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.11 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0376  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  36.59 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 410 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.53 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.88 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  26 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2718  transcriptional regulator, TetR family domain protein  26 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.087281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  32.61 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>