More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4333 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  89.05 
 
 
217 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  91.88 
 
 
197 aa  377  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  90.36 
 
 
197 aa  367  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  75.25 
 
 
220 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  65.64 
 
 
200 aa  271  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  61.69 
 
 
205 aa  267  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  60.48 
 
 
218 aa  264  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  60.61 
 
 
221 aa  264  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  60.5 
 
 
227 aa  263  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  61.08 
 
 
231 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  61.31 
 
 
215 aa  260  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  64.29 
 
 
220 aa  259  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  59.5 
 
 
226 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  59.42 
 
 
218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  60.1 
 
 
216 aa  257  8e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  58.54 
 
 
330 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  62.63 
 
 
225 aa  255  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  61.03 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  59.6 
 
 
211 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  60.31 
 
 
317 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  58.62 
 
 
204 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  58.71 
 
 
271 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  59.49 
 
 
205 aa  242  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 
207 aa  240  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  58.08 
 
 
199 aa  237  9e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  54.85 
 
 
215 aa  228  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
273 aa  207  7e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  34.09 
 
 
237 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
206 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 
223 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
224 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
224 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
224 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
224 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
224 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
215 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 
221 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
195 aa  89  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
218 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
220 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
224 aa  84.7  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  30.61 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  30.39 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  43.68 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  31.05 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  48.05 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  27.59 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  45.76 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>