More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3750 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 236 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  35.2 
 
 		 204 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 194 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  34.27 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  29.67 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  37.07 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1210  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0313613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  29.3 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  29.51 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  28.08 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>