222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5032 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  98.99 
 
 		 199 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.04 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  48.33 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  42.31 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  44.62 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 273 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  24.49 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3682  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  40.98 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 420 aa  45.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  27.07 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>