174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2442 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  64.22 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  68.34 
 
 		 202 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  68.72 
 
 		 202 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  61.11 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  69.12 
 
 		 210 aa  248  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  64.4 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 198 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  59.39 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 198 aa  228  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  54.87 
 
 		 197 aa  214  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  61.7 
 
 		 198 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 203 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  48.19 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  43.17 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.93 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 271 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 174 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 388 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 180 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 400 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  38.37 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  28.57 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  36.67 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  33.02 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 330 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>