More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3999 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 215 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 223 aa  89.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  30.11 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 205 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  40.79 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  37.38 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  32.46 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  28.08 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  27.59 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  35.2 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  39.13 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
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NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
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NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
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NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
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NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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