More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1939 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 253 aa  314  7e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  59.42 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  57.97 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  49.32 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 74 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1321 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  56.25 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 216 aa  72  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  51.43 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  40.62 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  43.08 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  47.62 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  32.39 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.07 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  38.33 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  44.26 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 209 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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