188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2968 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  80.68 
 
 		 219 aa  351  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  46.38 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  39.36 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  43.66 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 74 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  42.37 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  40.68 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  40.62 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  34.67 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 420 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3697  regulatory protein, TetR  31.78 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  30.6 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>