More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3691 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  77.44 
 
 		 186 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  43.88 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 213 aa  94.4  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 201 aa  94.4  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  53.85 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 220 aa  77.8  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  39.85 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  49.06 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  35.19 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  45.05 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  61.4 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  40.19 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  38.68 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  57.41 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  54.24 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  42.99 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 266 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  37.04 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  31.07 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  51.47 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4577  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.957651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  38.32 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  41.28 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  44.29 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  38.6 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  32.31 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>