More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2647 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 74 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  57.75 
 
 		 210 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 210 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  65.62 
 
 		 216 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  65.08 
 
 		 214 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  62.5 
 
 		 210 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  52.7 
 
 		 239 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  65 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  61.76 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 257 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 253 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 243 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 219 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  58.73 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  53.03 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  56.45 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 215 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 220 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  56.06 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  56.06 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 214 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 263 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 219 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 209 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 198 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 209 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 209 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 202 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  47.95 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 217 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 203 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 215 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  40.91 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 207 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 222 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  40.32 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 212 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 227 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 233 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  46.77 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  38.98 
 
 		 215 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 218 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 223 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 208 aa  50.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  40 
 
 		 215 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 223 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 262 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 231 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 217 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 222 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 207 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 216 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
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NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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