159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1981 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  28.93 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  31.63 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  25.25 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  35.23 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  34.52 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  36.46 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  32.58 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  34.21 
 
 		 258 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 74 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  39.73 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  38.36 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>