289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2679 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  28 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  43.04 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  28.8 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  34.09 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  37.5 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 74 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 396 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 309 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 400 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 209 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 253 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  25.99 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 195 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  25.99 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25.99 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 390 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  36.92 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25.99 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25.99 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  25.99 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>