More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1770 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2179  TetR family transcriptional regulator  57.35 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 125 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  41.1 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  38.81 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  37.8 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 290 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  41.94 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  34.34 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>