More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2672 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2179  TetR family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 217 aa  84.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  26.77 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  37.18 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  34.38 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  30.23 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.03 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  23.81 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32.23 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 259 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2043  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  28.65 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  36.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  44.78 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>